Климат континентальный субтропический. Лето в Египте жаркое, засушливое, а зима теплая с небольшим количеством осадков. Средняя температура января - от +12 градусов на севере до +16 градусов на юге, июля - соответственно +26 и +34 градусов. В пустынях суточные колебания температуры воздуха велики - до 50 градусов. Весной здесь нередки хамсины - песчаные бури. Основная доля осадков выпадает в декабре и январе, преимущественно в виде ливней. В горах Синая иногда идет снег.
Вследствие климатических условий большая часть Египта лишена растительного покрова, в пустынях во время зимних дождей местами появляются эфемеры (ирисы, маки, лютики). В зоне полупустынь растут злаки, ксерофитные кустарники, акации.
В средиземноморье флора более богата. (ковыль, степной лук, астрагал, шиповник, верблюжья колючка). В долине Нила по берегам водоемов произрастают папирус, пальмы (в т.ч. финиковая), тамарикс, олеандр, смоковница и др.
Животный мир беден. Млекопитающих(песчаных газелей, синайских леопардов, нубийских козерогов) можно встретить только в заповедниках; вне заповедных зон обитают шакалы, гиены, лисы, кабаны, мангусты. На территории Египта находятся зимовья европейских птиц, постоянно гнездятся в основном хищные - грифы, соколы, сарычи. В пустынях много пресмыкающихся (змеи - египетские кобры, змеи Клеопатры, эфы, гюрзы; ящерицы - вараны, гекконы, агамы) и насекомых.
